Přeshraniční výměna elektronické preskripce zpřístupňuje eRecept lékárníkovi v jiném zapojeném členském státě EU, než ve kterém byl daný eRecept vystaven. Český pacient si tedy může vyzvednout svůj lék v jakémkoli jiném členském státu EU, který bude nebo již je v rámci této přeshraniční výměny elektronických receptů zapojen v produkčním provozu.
Stejně tak jako v případě klasického českého eReceptu, jakmile lékárník provede výdej léku, tak následně po jeho výdeji bude odeslána informace o výdeji zpět do země vystavení eReceptu. Předepisující lékař následně má možnost nahlédnout, zda byl lék pacientem skutečně vyzvednut či nikoli.